食品生产过程中会产生大量的废水，这些废水主要来源于水洗、浸泡和压滤过程，另有部分冲洗水废水。食品加工所产生的废水属于有机废水，废水处理流程有氧生物处理、好氧处理、厌氧-氧结合处理等。
食品加工废水处理设备可分成一级处理、二级处理和三级处理。一级处理一般是采用固液分离技术去除污水中的悬浮物和漂浮物；二级处理是主要处理过程，一般采用生物处理技术去除水中有机物等有毒物质，一般采用膜处理法、强氧化剂等技术将污水进一步进化。
选择食品排放污水处理工艺，不仅要考虑污水中有害物质的组成，而且要了解排出污水水质、水量的瞬间变化情况，这些对选择污水处理工艺、设备和日后运行管理都很重要。
食品加工废水处理设备有较大的灵活性和调节余地，以适应水质水量的变化，同时设置应急事故超越排放管，以供紧急、特殊情况时使用；通过采用先进成熟的A/O法生化处理工艺，从而提高污染物的去除率，具有动力消耗少、投资省的特点确保出水达标排放。